Egy időben rabolják el McGarrett testvérét és forgatják fel az édesapjuk apartmanját, ahonnan ellopják a bajnoki díját. A csapat persze hatalmas lendülettel vág bele a nyomozásba, mely közben különös nyomokra…

A Waikiki-öbölben cirkáló tengeralattjáró utasai, miközben néhány különleges állatban gyönyörködnek, egy fiatal lány holttestét pillantják meg. Kiderül, hogy az áldozta Amanda Reeves, a fülöp-szigeteki nagykövet lánya, s emiatt a kormányzó…

Mary, Steve húga, Hawaii-ra érkezik, hogy végre elmenjenek az édesapjuk sírjához. A csapat közben egy börtönből szökött férfi után nyomoz. Hamarosan pedig kiderítik, hogy McGarrett valakit ki akar rabolni, akit…